Противопоказаниями к проведению собственно радиоизотопного исследования служит беременность и кормление грудью. Остальные противопоказания зависят от протокола исследования и включают стандартные противопоказания к проведению нагрузочных проб. Не следует забывать, что при проведении перфузионной сцинтиграфии существуют технические ограничения по весу пациента (в зависимости от фирмы-производителя гамма-камеры верхний предел массы тела колеблется от 120 до 180 кг).