Около 20% нелеченых проксимальных (т.е. выше голени) глубоких флеботромбозов приводит к ТЭЛА, 10–20% из них заканчивается летально. При агрессивной антикоагулянтной терапии смертность снижается в 5–10 раз. Прогноз при ХПН, хронической сердечной недостаточности, лёгочной гипертензии, протекающих с отёками, соответствует стандартному прогнозу при этих заболеваниях.